什么是保守序列
中文名称：保守序列 英文名称：conserved sequence 定义1：在进化过程中，核酸或蛋白质分子中不变或变化不大的核苷酸或氨基酸序列。 应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科）；总论（二级学科） 定义2：在进化过程中，核酸或蛋白质分子中不变或变化不大的核苷酸或氨基酸序列。 应用学科：细胞生物学（一级学科）；细胞遗传（二级学科）
保守序列（Conserved Sequence ）：指DNA分子中的一个核苷酸片段或者蛋白质中的氨基酸片段，它们在进化过程中基本保持不变。
什么是保守氨基酸
就是指不同，但具有一定进化关系的蛋白质的氨基酸序列中相同的氨基酸序列中的氨基酸残基，就叫做保守氨基酸残基。
如何通过比对得到若干条氨基酸序列的保守序列
首先,你要把这个基因的起始位点标出来,就给这么点序列,不好给你分析.上面的DNA序列也不像从头开始的啊.下面的RNA序列也不知道是从什么地方开始的.这段基因到底是在基因的什么位置?
设计realtimePCR引物,一般选择mRNA的前边部分,另外,你这段序列的长度也不够,一共才119bp,扩增出来也不好区分,建议设计长度在150bp左右或者到200bp左右.可以明显降低实验的难度.引物二聚体的大学基本都差不多100bp大小了.为了实验方便,可以重新设计一下.
至于你对比的序列,有一个缺失或者是多出来一个,都是有可能的,建议你从新做一些反转录,看看再扩增出来测序结果怎么样.并且有这么一个缺少或者插入,只要不是引物中间的,对引物的敏感性就没有明显影响.不影响realtimePCR试验的结果.
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