根腐病是油菜苗期主要病害之一，有多种真菌侵染引起。近年来随着种植结构的调整，该病发生日趋严重，一般株发病率为3％-5％，重病田达10％-20％，给油菜苗安全越冬造成严重威胁。
症状主要为害幼苗根部和根茎部，引起未出土或刚出土幼苗茎基部初呈水渍状，后变褐，致油菜幼苗根茎腐烂。
病原该病为多种真菌侵染引起。主要病原有AlternariatenuisNees称链格孢、FusariumoxysporumSchlecht称尖镰孢菌、PythiumdebaryanumHesse称德马利腐霉，此外还有SclerotiumrolfsiiSacc.称齐整小核菌。
Alternariatenuis分生孢子梗分枝或不分枝，淡榄褐色至绿褐色，屈曲，顶端孢痕多个，大量小5-125×3-6(μm)。分生孢子10个呈长链生，具喙或无喙，椭圆形、卵形、肾形、倒棍棒形至圆筒形，平滑或具瘤，具横隔1-9个，纵隔0-6个，淡榄褐色至深榄褐色，大小7-70.5×6-22.5(μm)，喙大小1-58.5×1.5-7.5(μm)，该菌寄生性不强，但寄主范围广。
Fusariumoxysporum子座灰褐色。大型分生孢子在子座或粘分生孢子团里生成，镰刀形，弯曲，基部有足细胞，多3隔膜，大小19-45×2.5-5(μm)，5个隔膜的30-60×3.5-5(μm)。小型分生孢子1-2个细胞，卵形或肾脏形，大小5-26×2-4.5(μm)，多散生在菌丝间，一般不与大型分生孢子混生。厚垣孢子球形，平滑或具褶，大多单细胞，顶生或间生，大小5-15μm。该菌还可侵染番茄、马铃薯、甜瓜、草莓等。
P.debaryanumSclerotium菌丝直径约5μm，孢子囊球形至卵形，大小15-27μm。卵孢子球形，平滑，直径10-28μm，不满器，壁薄，厚度约1μm。
SclerotiumrolfsiiSacc.有性态为Atheliarolfsii(Curzi)Tu.&Kimbrough.称罗耳阿太菌，属担子菌亚门真菌。在PDA培养基上菌丝体白色，茂盛，呈辐射状扩展。菌丝粗2-8μm，分枝不成直角，具隔膜。菌核初为乳白色，后变浅黄色至茶褐色或棕褐色，球形至卵圆形，大小1-2mm，表面光滑具光泽，由3层细胞组成，外层棕褐色，表皮层下为假薄壁组织，中间为疏丝组织。
发病特点
Alternariatenuis以菌丝体和分生孢子在病残体上或随病残体遗落土中越冬，翌年产生分生孢子进行初侵染和再侵染。该菌寄生性虽不强，但寄主种类多，分布广泛，在其他寄主上形成的分生孢子，也是该病的初侵染和再侵染源。雨季利于该病扩展。
Fusariumoxysporum主要以菌丝体、分生孢子及厚垣孢子等随植株病残体在土壤中或种子上越夏或越冬，未腐熟的粪肥也可带菌。病菌可随雨水及灌溉水传播，从根部伤口或根尖直接侵入，侵入后经薄壁细胞到达维管束，在维管束中，病菌产生镰刀菌素等有毒物质，堵塞导管，致植株萎蔫枯死。P.debaryanum病菌以卵孢子在土壤中存活或越冬。翌年条件适宜产生孢子囊，以游动孢子或直接长出芽管侵入寄主。
Sclerotiumrolfsii以菌核随病残体遗落土中越冬。翌年条件适宜时，菌核产生菌丝进行初侵染。病株产生的绢丝状菌丝延伸接触邻近植株或菌核借水流传播进行再侵染，使病害传播蔓延。连作或土质粘重及地势低洼或高温多湿的年份或季节发病重。
防治方法
（1）因地制宜种植抗病品种。
（2）重病地避免连作。
（3）加强田间管理。
科学施肥，提倡施用日本酵素菌沤制的堆肥或充分腐熟有机肥，增施磷钾肥，提高植株抗病力；合理灌溉，防止大水漫灌，雨后及时开沟排水，降低田间湿度；田间发现病株及时拔除，收获后及时清除田间病残体，减少来年菌源。
（4）药剂防治。
及时检查，发现病株及时拔除、烧毁，病穴及其邻近植株淋灌5%井冈霉素水剂1000-1600倍液或50%田安水剂500-600倍液、20%甲基立枯磷乳油1000倍液、90%敌克松可湿性粉剂500倍液，每株(穴)淋灌0.4-0.5L或用40%拌种灵加细沙配成1：200倍药土；每穴100-150g，隔10-15天1次。或用培养好的哈茨木霉0.4-0.45kg，加50kg细土，混匀后撒覆在病株基部，能有效地控制该病扩展。
常用药剂井冈霉素、田安、甲基立枯磷、敌克松、拌种灵、哈茨木霉。
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