甜瓜嫁接，在选择砧木时，要选择亲缘关系近的植物作为砧木，最好是同一属的植物，亲缘关系较近的植物之间嫁接时的亲和力比较强，嫁接完成后伤口愈合比较快，成功率也会比较高。砧木的范围确定之后，还要考虑砧木对接穗的生长尤其是对瓜果等果实的口感、形状等形状的影响问题。所选的砧木在嫁接后应该对接穗果实的口感、形状等性状没有影响或者影响不大为标准。甜瓜砧木可以选择南瓜、冬瓜、葫芦等，其中南瓜是用的比较多的一种砧木，一般会选择抗性较强，耐旱，座果率高的黑籽南瓜品种。甜瓜砧木价格在75元一斤左右。
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