基地的选择 在进有机水稻生产规划时。基地选择是重中之重，这是有机生产的成功开始。席运官认为理论上能进行常规生产的田块就可进行有机生产，因为有机农业强调的是转换，要通过有机生产方法将常规系统转变为平衡的可持续发展系统，这和绿色食品首先强调良好的生态环境是不同的。
但是我国农业环境污染比较严重,因此选择有机食品基地时还是要考虑地块的周边环境问题。
品种选择 有机稻品种的选择，既要注重品种优质化，又要考虑栽培地区的气候条件和土壤情况。曹黎明、沈国辉等人在上海市屏东有机农场通过2年试验结果表明，产量表现较高的品种有嘉花1号、9915、寒优湘晴、太湖糯等。
初步确定了嘉花1号、寒优湘晴等品种作为有机稻米生产的主要品种，银香18、紫香糯等品种作为搭配种植，这些品种不但产量较高，品质优良，而且具有香、糯、色、不同熟期等特点，有利于提高有机栽培过程中品种的防、避虫能力。
土壤培肥管理 作物秸秆、禽畜粪肥、豆科作物、绿肥、菜籽饼等有机生物肥料是有机水稻田块土壤肥力培肥的主要来源昀。
另外目前还有一种光合生物有机肥，该肥料集有机肥、微生物肥于一体，养分全、用途广、利用率高，是一种新型的绿色环保肥料。
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