本周比较重要的另一个消息是人工智能在蛋白质结构预测——蛋白质折叠问题破解方面的进展。类似这样的应用,才是人工智能真正的价值点、AI真正应该突破的重要方向之一,人脸识别之类还是歇一歇吧,至少不要那么突出为好。距离推出整整两年时间过去,DeepMind的Alphafold(第二代)技惊四座说不上,已经取得重大成果没有人能否认。蛋白质是氨基酸链组成的有独特3D结构的复杂分子。蛋白质折叠问题,也就是蛋白质折叠成何种形状一直是生物学领域的重大挑战。国际蛋白质结构预测竞赛 CASP 中,AlphaFold击败其他选手,准确性方面比肩人类实验结果,有望成为蛋白质结构预测的重要方向。AI 对于基础科研的作用将更受重视。上周参加腾云峰会,互动论坛第三场饶毅、韩启德、阿来、张胜誉激辩的其中一个问题,AI+算力(量子计算等)辅助生物医药研究未来靠不靠谱。饶毅说不靠谱,但答案是不仅靠谱,现在已经在取得进展。虽然蛋白质折叠结构预测和药物分子研究有所不同,但都是在探索“分子空间这个很大的宇宙中的一个很小的角落”。硕大地球不也只是很小的一个角落、宇宙里的一粒尘埃吗?!
近日,日本北海道大学的科学家基于量子化学计算预测的反应路径,成功合成了一种α,α-二氟甘氨酸衍生物,属于α-氨基酸门类。结合实验化学和计算化学的新型混合方法,可以创新化学反应。
该小组正在通过人工诱导反应(AFIR)方法,建立相关信息的数据库,并希望与信息科学家一起使用,将此方法用于制造精细化学物质和功能性材料,发现新型药物等,以加快新型化学的发展。
微量元素指占生物体总质量0.01%以下,且为生物体所必需的一些元素。如铁、硅、锌、铜、碘、溴、硒、锰等。微量元素为植物体必需但需求量很少的一些元素。这些元素在土壤中缺少或不能被植物利用时,植物生长不良,过多又容易引起中毒。
在农业中,常以微量元素作种子处理、根外追肥来提高作物产量。这些微量元素在体内的含量虽小,但在生命活动过程中的作用是十分重要的。
镁的作用
1、叶绿素合成及光合作用
镁的主要功能是作为叶绿素a和叶绿素b卟啉环的中心原,在叶绿素合成和光合作用中起重要作用。镁原子同叶绿素分子结合后,才具备吸收光量子的必要结构,才能有效地吸收光量子进行光合反应。
2、蛋白质的合成
镁作为核糖体亚单位联结的桥接元素,能保证核糖体稳定的结构,为蛋白质的合成提供场所。叶片细胞中有大约75%的镁是通过上述作用直接或间接参与蛋白质合成的。
3、酶的活化
植物体中一系列的酶促反应都需要镁或依赖于镁进行调节。镁在ATP或ADP的焦磷酸盐结构和酶分子之间形成一个桥梁,大多数ATP酶的底物是Mg-ATP。在活化磷酸激酶方面,镁比其他离子(如锰)更为有效。
4、镁参与DNA和RNA的生物合成
镁是稳定核糖体颗粒,特别是多核糖体所必需的,也是功能RNA蛋白颗粒进行氨基酸与其他代谢组分按顺序合成蛋白质所必需的。
5、镁能促进Va、Vc的生物合成,提高水果、蔬菜的品质。
锌
锌是植物必需的微量元素之一。锌以阳离子形态被植物吸收。锌在植物中的移动性属中等。同时锌也是许多酶的活化剂,通过对植物碳、氮代谢产生广泛的影响,因此有助于光合作用。
锌的作用
1、 是一些脱氢酶、碳酸酐酶和磷脂酶的组成元素,这些酶对植物体内的物质水解、氧化还原过程和蛋白质合成起重要作用。
2、参与生长素吲哚乙酸的合成,锌在作物体内间接影响着生长素的合成,当作物缺锌时茎和芽中的生长素含量减少,生长处于停滞状态,植株矮小。
3、稳定细胞核糖体的必要成分。
4、参加叶绿素的形成。植物缺锌生长发育停滞、叶片缩小、茎节缩短。中国缺锌土壤较多。缺锌土壤施锌增产效果显著,水稻和玉米尤为突出。
5、同时锌还可增强植物的抗逆性;提高籽粒重量,改变籽实与茎杆的比率。
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