棉花立枯病俗称烂根病、黑根病。由立枯丝核菌引起，主要是寄生生活，也可腐生。病菌以菌丝体或菌核在土壤中或病残体上越冬，在土壤中形成的菌核可存活数月至几年。立枯丝核菌可抵抗高温、冷冻、干旱等不良环境条件，适应性很强，一般能存活数年，且耐酸碱，在pH值2．4～9．2范围内均可生长。因此，该菌的寄主范围极其广泛，分布很广。
棉籽苗受害后，在近地面茎的茎基部产生黄褐色斑点，逐渐扩大，产生凹陷内缩。凹陷部因失水过多而呈缢缩状变细，后变成黑褐色并且腐烂受侵后，棉苗枯萎。
立枯病的初次侵染主要来自土壤，带菌种子也可传染。棉苗未出土前，立枯丝核菌可侵染幼根和幼芽，造成烂种和烂芽。棉苗子叶期最易感病，棉苗出土的1个月内如果土壤温度持续在15℃左右甚至遇到寒流或低温多雨，立枯病就会严重发生，造成大片死苗。若收花前低温多雨，棉铃受害，病菌还可侵入种子内部，成为下一年的初次侵染来源。播种过早，气温偏低，棉花萌发出苗慢，病菌侵染时间长，发病重。多年连作棉田发病重。地势低洼、排水不良和土质粘重的棉田发病较重。
防治方法：
1.喷雾。在发病初期用适乐时 （适麦丹）10毫升+5毫升爱多收对一桶水，顺棉苗主茎喷雾，使药液顺主茎滴入土壤，连喷2~3次为宜，间隔10~15天。对于防止棉花苗起到立枯病有特效。
2.灌根。在发病初期用申嗪霉素15毫升+天达2116壮苗灵25毫升对一桶水灌根，连灌2~3次为宜，间隔5~7天。
3.涂刷。也可用适乐时（适麦丹）10毫升+5毫升爱多收或申嗪霉素15毫升+天达2116壮苗灵25毫升对0.5公斤水，扒开棉棵周围的土使其露出病斑，用毛刷涂刷，连续2~3次为宜，间隔7~10天。
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