粪便不能直接作为肥料使用的原因主要有以下几点：
传染病虫害：
粪便中含有大肠菌、线虫等病菌和害虫，直接使用会导致病虫害的传播、作物发病，对食用农产品的人体健康也产生影响。
发酵烧苗：
不发酵的生粪施到地里后，在微生物的活动下发酵，当发酵部位距根较近或作物植株较小时，发酵产生的热量会影响作物生长，严重时导致植株死亡。
毒气危害：
在分解过程中产生甲烷、氨等有害气体，使土壤和作物产生酸害和根系损伤。
土壤缺氧：
有机物质在分解过程中消耗土壤中的氧气，使土壤暂时性地处于缺氧状态，这种缺氧状态会使作物生长受到抑制。
肥效缓慢：
未发酵腐熟的有机肥料中养分多为有机态或缓效态，不能被作物直接吸收利用，只有分解转化成速效态才能被作物吸收利用，所以未发酵直接施用使肥效减慢。
未经处理直接使用，粪便体积大，有效成分低，运输不便，使用成本高 。
重金属危害：
由于集约化养殖使用的饲料含有添加剂，这些添加剂中多含有铜、锌、铅等重金属元素，畜禽对微量元素的利用率通常较低，随粪尿排出体外，导致重金属含量增加，从而对农作物造成危害。
土壤盐渍化：
长期使用未发酵的粪肥，会导致土壤出现盐渍化现象，影响土壤的通透性和活性，进而影响作物的生长和产量。
综上所述，粪便不能直接作为肥料使用，需要经过堆肥处理，以消除其中的病菌、虫害、有害物质，并提高其肥效和安全性。
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