葡萄柚在低于10℃时易受冷害，引起褐变、腐烂和水肿；湿度过低会促进外皮败坏。除易受冷害外，在贮藏过程中最大的问题是蒂腐及发生绿霉病等腐烂病害。其防治方法，特别是药物处理方法，可参照柑橘防腐方法，一般采用涂蜡和多菌灵加2，4-滴药液浸果均能较有效的防治葡萄柚等柚类的腐烂病。
值得注意的是无论采用什么样的贮藏方法，葡萄柚的品质都不会得到改进，贮藏的时间越长，果汁和风味损失越大，果皮的变质和腐烂也随着贮藏时间的延长而增多。
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