杂交制种玉米抽雄后的管理是指从玉米母本抽雄结束后到种子收获这一阶段的管理，时间大约从7月底到9月中旬。
一、灌水施肥
抽雄结束后结合第1次浇水每公顷追施尿素150千克左右，为防止尿素挥发，可以在浇水前人工均匀撒施于玉米沟中，撒完后立即浇水，或将尿素溶于水后随水浇入地中。
二、病虫害防治
制种玉米抽雄后病虫害的防治工作主要是对红蜘蛛的防治。在抽雄过程中由于农事操作将红蜘蛛带入地中，为了人员的安全又不能进行喷药防治。以往的做法是在父本散完粉后，将父本割倒后从父本行利用电动喷雾器进行喷药防治。据观察此种方法防治红蜘蛛效果较差，由于抽雄结束到父本花粉散尽还需一段时间，在防治时，红蜘蛛往往已经大面积发生。推荐一个效果较好的方法。具体做法：在抽雄结束后，用木棍制一A字架，A字架宽度略宽于制种玉米行距。使用时两人合作，一人站在A字架前部，一人站在A字架开口处，前边的人利用A字架将玉米植株分开便于后边的人喷药操作，后边的人背负电动喷雾器倒着走进行喷药作业。注意事项：①操作者均需佩带防护装置，如冬天骑摩托车用的头盔（全盔）和雨衣；②操作时应有两组以上的人员轮换操作，一组人员喷完一行后立即休息换另一组继续操作，不可连续操作以防发生意外；③最好选在阴天或傍晚进行，同时对于地头特长（超过300米）应从中间向两边交叉进行。使用此种方法可以在抽雄结束后立刻进行，大大提前了防治红蜘蛛的时间，此时红蜘蛛还未能形成危害，虫口密度较父本散完粉后要低的多，提高了防治效果。
三、浇水原则
制种玉米抽雄结束后，正是玉米籽粒灌浆时期，天气炎热，作物需水量较大，此时应根据天气变化考虑浇水次数和停水时间，既要保证玉米籽粒灌浆对水的需要又要适时停水防止玉米贪青晚熟。根据制种玉米不同生育期在成熟前一个月停水较为合适，北疆停水时间一般控制在8月底9月初较为适宜，早停易使玉米受旱减产，晚停易造成收获推迟。
四、鼠害防治
近年来制种玉米地中鼠害的危害呈上升趋势，制种玉米成熟过程中和果穗晾晒中，老鼠只啃食果穗上玉米籽粒表面一小部分，籽粒的大部分仍然留在果穗中，对产量影响不大，大多数制种户在脱粒时仍将此种果穗混入其他果穗中，而籽粒被老鼠啃去部分的种子很难与其它好种子分离出来，严重影响种子的外观，降低种子的商品性。
五、适时收获
制种玉米适时收获可以利用秋后少雨天气进行自然晾晒，北疆晾晒时间在10月底之前最为有利，之后气温迅速下降，夜晚空气湿度较大并有霜，种子脱水困难，不利于晾晒，甚至部分种子夜晚还会吸收空气中的水分，水分升高，同时种子受冻会危害影响发芽率。为了充分利用北疆有利天气，制种玉米收获一般在腊熟期收获较为合适，收的过早，灌浆未完全，千粒重降低，影响产量和种子质量；收的过晚，果穗易从植株上掉落在地上霉烂，影响产量。北疆制种玉米收获最好在9月底之前完成，10月上旬完成脱粒工作，这对后期的晾晒和收购都较为有利，同时可以避开低温的危害。
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