1、主要病害
根腐病 开春是黄花菜根腐病的高发期，表现为返青晚，叶片细小，根茎发黑，肉质腐烂，初发时点片发生，有明显的发病中心。轻时不抽苔，重时整穴死亡。
黄叶病 多为生理性病害，表现为叶片黄化失绿，生长发育缓慢。发病原因是多方面的，施肥不当，浇水过多，土壤板结，耕作不当，伤根严重，地下害虫为害，缺素等。
叶斑病 主要为害叶片和茎苔，发病初期在嫩叶中部沿叶脉附近出现暗绿色针尖大小点，以后成为黄色斑点，边缘呈水渍状、半透明状，病斑纵间比横间扩展快，病斑发生在叶尖上则叶尖枯死；花茎苔受害严重时，萎缩枯死。有明显的发病中心，严重时大片叶片干枯，像火烧一样，多发生在春夏之交的多雨年份，高湿低温情况下发病严重。
锈病 黄花菜锈病与小麦的叶锈病症状相似，是由真菌引起的病害。黄花菜锈病是近几年关中地区流行最广、危害最重的病害，前几年多发生在花蕾末期，主要影响黄花菜的秋季生长，宿根的养分积累，近年来发病期连年提前，初蕾期就出现锈病流行。病害初期叶片及茎苔上产生铁锈色泡状斑点，以后散发黄褐色粉末状孢子，孢子堆排列没有规则，孢子堆周围的叶片往往失绿而呈现淡黄色圈。孢子堆多时，整个叶片都变成黄色。有明显的发病中心，先是点片发生，逐步扩散全田。
主要虫害
蓟马 成虫体徽小，深褐色，翅两对，狭长透明，若虫淡灰色。成虫和若虫多集中在叶背面或花苔的舌叶夹缝中，危害叶片、舌叶及嫩苔，影响茎苔和花蕾的正常生长。
黄花蚜虫 系无翅胎生蚜虫，体长3－5cm，全身粉白色，卵有小米粒大，幼虫体绿色，有足3对，分泌物能引赵蚂蚁，能孤雌生殖，繁殖速度快。黄花蚜虫先是群集于叶背，后又蔓延到花苔、花蕾上，严重时花蕾全部被虫体覆盖成白色，宛如蜡烛一般。蚜虫主要吸食花蕾上的汁液，使花蕾发育不良和脱落，影响产量和质量。
地下害虫 黄花菜的根部易遭受蛴螬为害，春季随地温上升，蛴螬咬食花肉质根，影响根的吸收功能。
病虫害防治
基腐病的防治 一是繁殖时不能用有疾病田块的根苗，施用机肥时，不能用黄花菜叶沤制的堆肥。二是在发病中心周围挖深宽各30cm的环形沟，生石灰和土1：3的混合土填平沟，进行封锁防扩散。对病穴用1：1：100的波尔多液或500倍的70%甲托灌根，每穴1公斤药液，每7天灌一次，共灌三次。
对黄叶病应对症下药，区别诊治。要合理运用水肥，耕作方法要适当，特别是生长发育高峰期，施肥中耕等，农田作业应避免免伤根，对于因缺素引起的黄叶病要增加追肥和叶面喷肥，追肥用氮肥、利宝多、磷钾肥或多元复肥为主。?施天丰素、利宝多、磷酸二氢钾、铁肥等。地下害虫为害时，灌水前亩撒施1公斤3%的呋喃丹，虫口密度大时用5%的200倍辛硫磷药液灌根，每穴0.5公斤。
黄花菜抽苔前，进行一次全面的病虫害检查和防治，喷洒500倍代森锰锌、3000倍吡虫啉或啶虫咪和有关营养液混合，达到防病治虫、增加营养的效果。
黄花菜现蕾后要注意锈病的发生，发现一点治一片，发现一片治全田。点片发生时，喷700倍代森锰锌与1000倍25%粉锈宁混合水溶液，实行防治结合，间隔7－10天再喷一次，锈病流行时，必须连续喷药防治三次以上。
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