目前我国的苹果砧木主要分两种，一种是常见的自然形成的实生基砧（乔化砧），是人们最早用于嫁接苹果的砧木，比较常见的有山定子、海棠等；另一种则是人工培育的矮化砧，这种砧木经过人工的培育，在嫁接以后苹果树会出现矮化性状，高度一般在2-3米左右，方便采摘。常见的有英国的M系和MM系，原苏联的B系、美国的C系、加拿大的O系、波兰的P系和瑞典的A系等。根据砧木的不同，嫁接方式也有所差异，很多砧木可以直接嫁接，但是有些砧木却因为根系不发达，抗旱涝能力差等原因更适合做中间砧，即先将中间砧嫁接与基砧之上，成活后翌年再将苹果嫁接与中间砧之上，这样既继承了基砧的生长适应能力，又继承了中间砧的矮化特性。苹果砧木价格在0.5元一棵左右。
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