选择黑豚种豚时，应选择具有体态丰满、骨骼粗壮结实、毛色明亮、身体呈流线形、眼睛明亮、鼻子潮湿且无脱毛现象等特点的种鼠。公鼠要求睾丸对称，阴茎发育正常，母鼠则要求外阴干净，乳房发育良好。在管理种豚时，为保持种群旺盛的产能，应及时淘汰生长不良的老鼠，当老鼠连续使用12-18个月后也要淘汰。
一、黑豚种豚的选择方式
黑豚养殖留种时一定要选择优良个体作为父母鼠，其参考标准如下：
1、体态丰满，营养好，骨骼粗壮结实。
2、毛色明亮，被毛干净且密集。
3、身体呈流线形，头、颈、胸、腹、臀结构紧凑，行动敏捷活跃。
4、眼睛明亮，无分泌物，鼻子潮湿，没有脱毛现象，呼吸稳定。
5、公鼠睾丸对称，阴囊皮肤细腻，阴茎发育正常。母鼠外阴干净，乳房发育良好，乳头突出。
二、管理种豚的方法
1、根据各品系的特征，选择体质强、活力强、抗病能力强的父母鼠的2-5胎小鼠留种，及时淘汰生长不良的小鼠。留种的豚鼠饲养管理与繁殖鼠基本相同，但要注意营养适度，以免过度肥胖，导致不孕。
2、保持种群旺盛的产能。种鼠连续使用12-18个月、生产5胎以上就可以淘汰，体弱生病的也要淘汰。对于因生产而过度消耗的豚鼠（脱毛、消瘦），应停止配种，休息一段时间恢复后再生产。
3、做好记录。豚鼠生产中的记录与小鼠基本相同，单色豚鼠个体的记录可采用打耳号的方法，多色豚鼠记录可利用体表毛色分布位置的不同来记录。
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