幼苗期：基部出现浅褐色水浸状，湿度大时长出白色絮状霉，即白色菌丝，干燥后灰白色，病部缢缩，严重时幼苗枯死。
成株：发病时叶片叶缘淡绿色水渍状，如果湿度大，会长出少量白霉，病斑呈灰褐色。
茎部染病：叶柄基部会出现灰白色病斑。
果实染病：蒂部会出现油渍状斑块，之后发展成暗绿色病斑，病斑逐渐扩大后可见少量不规则黑色菌粒。
一、哈密瓜菌核病病症
1、苗期基部开始发病，病部出现浅褐色水浸状，如果湿度大，还会长出白色絮状霉，即白色菌丝，呈软腐状，干燥后灰白色，病部缢缩，幼苗枯死。
2、成株发病叶片叶缘淡绿色水渍状，如果湿度大，会长出少量白霉，病斑呈灰褐色，病情蔓延非常快，之后病叶会枯死。茎染病后叶柄基部出现灰白色病斑，稍凹陷，后期表皮纵向开裂，病髓部中空，剥开茎部可见大量菌核，严重时植株枯死。
3、果实染病后蒂部出现油渍状斑块，不久发展成暗绿色病斑，圆形凹陷，病斑逐渐扩大后可见大量棉絮状菌丝、少量不规则黑色菌粒。
二、哈密瓜菌核病防治方法
1、深耕翻地，施足腐熟有机肥，然后高温闷棚，棚温高于60℃即可杀死有机肥和土壤中的菌核。深耕翻地是为了使菌核埋入耕层下半部，菌核就不能萌发了。
2、播种前用10%盐水漂种，需要漂2-3次以汰除菌核。也可以塑料棚采用紫外线塑料膜，抑制子囊盘及子囊孢子形成。也可用采用高畦覆盖地膜抑制子囊盘出土释放子囊孢子减少菌源。
3、培育无病幼苗，定植后及时覆盖地膜，育苗是发病率低，也可利用地膜抑制菌核萌发及子囊盘出土。
4、控制好棚室温度、湿度，合理降湿、升温以减少菌核及子囊孢子数量，控制传播蔓延。可用上午闷棚提温、下午放风排湿，发病后适当提高夜温，这样可以减少结露，早春日均温度30℃左右、相对湿度低于65%发病几率低，建议延长浇水间隔期，避免浇水过量、土壤湿度大。
5、可以使用烟雾剂、粉尘剂防治，于发病初期亩用10%速克灵烟雾剂250-300g，傍晚熏烟，密闭一个晚上。于傍晚亩喷5%百菌清粉剂1千克亦可，间隔一周防治第二次。
6、盛花期或发病初期喷施药剂防治，可以选用50%农利灵或速克灵可湿性粉剂1000-1500倍液、40%菌核净1000-1500倍液、50%多菌灵可湿性粉剂或50%托布津500倍液，每周喷一次，连续喷3-5次。
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